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本院前瞻性研究中心的建構的基本準則為：

1. 在國際一流的研究領導者的領導下，成立高度自主性、開放性、和功能性的核心研究中心。

2. 因應科技發展與時代潮流，擬設各「研究群」或「中心」，各中心或研究群必須結合基礎計畫與臨床計畫，打破目前行政編制之藩籬，以藉研究成果促成醫療品質之進步。

3. 各研究中心或研究群，彼此形成嚴密的網路，以扁平的經營管理，進行挑戰。鼓勵各研究單位之間的競爭評比，以做為研究經費之分配依據。

4. 要求各研究中心或研究群與國際知名研究單位進行合作，使研究成果得以與世界尖端科技和知識同步發展。

5. 成立產學合作的共同研究區，促成本院、大學與民間企業互補且互相合作，以進行創新技術的開發。